Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U595 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U595 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U595 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U595 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3U595 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U595 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U595 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U595 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U595 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U595 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U595 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U595 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U595 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U595 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3U595 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U595 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U595 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U595 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U595 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U595 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U595 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U595 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U595 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U595 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U595 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U595 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U595 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U595 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U595 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U595 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U595 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3U595 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U595 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U595 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U595 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U595 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U595 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3U595 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3U595 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3U595 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3U595 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3U595 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3U595 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q3U595 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U595 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U595 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U595 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U595 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U595 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U595 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U595 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U595 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U595 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U595 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U595 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U595 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U595 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U595 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U595 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U595 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U595 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U595 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U595 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q3U595 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U595 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U595 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U595 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U595 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U595 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U595 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U595 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U595 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U595 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U595 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U595 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U595 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U595 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U595 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U595 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U595 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U595 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U595 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U595 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U595 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q3U595 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U595 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U595 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U595 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U595 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U595 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U595 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U595 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U595 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U595 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U595 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U595 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3U595 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U595 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U595 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms