Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

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Length 584 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam117bQ3U3E2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam117bQ3U3E2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam117bQ3U3E2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam117bQ3U3E2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam117bQ3U3E2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam117bQ3U3E2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam117bQ3U3E2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam117bQ3U3E2 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam117bQ3U3E2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam117bQ3U3E2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam117bQ3U3E2 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam117bQ3U3E2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam117bQ3U3E2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam117bQ3U3E2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam117bQ3U3E2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam117bQ3U3E2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam117bQ3U3E2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam117bQ3U3E2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam117bQ3U3E2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam117bQ3U3E2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam117bQ3U3E2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam117bQ3U3E2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam117bQ3U3E2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam117bQ3U3E2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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