Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sec24aQ3U2P1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sec24aQ3U2P1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms