Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tmem35bQ3U0Y2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms