Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWN3

Cnnm2, Metal transporter CNNM2, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm2Q3TWN3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnnm2Q3TWN3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms