Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Calr4Q3TQS0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Calr4Q3TQS0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Calr4Q3TQS0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms