Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctdnep1Q3TP92 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctdnep1Q3TP92 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms