Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf3c3Q3TMP1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gtf3c3Q3TMP1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms