Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pdlim7Q3TJD7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdlim7Q3TJD7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms