Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGW2

Eepd1, Endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eepd1Q3TGW2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eepd1Q3TGW2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eepd1Q3TGW2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms