Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RubcnlQ3TD16 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RubcnlQ3TD16 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms