Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem104Q3TB48 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem104Q3TB48 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms