Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccbe1Q3MI99 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccbe1Q3MI99 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms