Protein–RNA interactions for Protein: Q32NY4

Cnnm3, Metal transporter CNNM3, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm3Q32NY4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm3Q32NY4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm3Q32NY4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm3Q32NY4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm3Q32NY4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm3Q32NY4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm3Q32NY4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm3Q32NY4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm3Q32NY4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnnm3Q32NY4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm3Q32NY4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm3Q32NY4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm3Q32NY4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm3Q32NY4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm3Q32NY4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm3Q32NY4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm3Q32NY4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm3Q32NY4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnnm3Q32NY4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cnnm3Q32NY4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cnnm3Q32NY4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cnnm3Q32NY4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnnm3Q32NY4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnnm3Q32NY4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms