Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hdgfl1Q2VPR5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms