Protein–RNA interactions for Protein: Q14A28

Prok1, Prokineticin-1, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prok1Q14A28 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prok1Q14A28 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prok1Q14A28 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms