Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpusd2Q149F1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms