Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ppp4r2Q0VGB7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp4r2Q0VGB7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms