Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r181Q0P547 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r181Q0P547 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r181Q0P547 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r181Q0P547 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r181Q0P547 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r181Q0P547 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r181Q0P547 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r181Q0P547 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r181Q0P547 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r181Q0P547 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r181Q0P547 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r181Q0P547 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r181Q0P547 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r181Q0P547 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r181Q0P547 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r181Q0P547 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r181Q0P547 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r181Q0P547 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r181Q0P547 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r181Q0P547 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r181Q0P547 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r181Q0P547 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r181Q0P547 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r181Q0P547 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r181Q0P547 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r181Q0P547 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r181Q0P547 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms