Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc7a1Q09143 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc7a1Q09143 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms