Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pate4Q09098 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms