Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cnn1Q08091 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms