Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MestQ07646 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MestQ07646 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MestQ07646 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MestQ07646 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MestQ07646 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MestQ07646 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MestQ07646 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MestQ07646 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MestQ07646 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MestQ07646 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MestQ07646 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MestQ07646 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MestQ07646 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MestQ07646 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MestQ07646 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MestQ07646 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MestQ07646 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MestQ07646 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MestQ07646 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MestQ07646 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MestQ07646 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
MestQ07646 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MestQ07646 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MestQ07646 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MestQ07646 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MestQ07646 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MestQ07646 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MestQ07646 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MestQ07646 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MestQ07646 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MestQ07646 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MestQ07646 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MestQ07646 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MestQ07646 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MestQ07646 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MestQ07646 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
MestQ07646 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
MestQ07646 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MestQ07646 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MestQ07646 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MestQ07646 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MestQ07646 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MestQ07646 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MestQ07646 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MestQ07646 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MestQ07646 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MestQ07646 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MestQ07646 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
MestQ07646 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MestQ07646 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MestQ07646 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MestQ07646 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MestQ07646 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MestQ07646 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MestQ07646 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MestQ07646 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MestQ07646 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MestQ07646 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MestQ07646 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
MestQ07646 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MestQ07646 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MestQ07646 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MestQ07646 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MestQ07646 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MestQ07646 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
MestQ07646 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
MestQ07646 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MestQ07646 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MestQ07646 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MestQ07646 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MestQ07646 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MestQ07646 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MestQ07646 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MestQ07646 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MestQ07646 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MestQ07646 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
MestQ07646 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MestQ07646 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MestQ07646 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MestQ07646 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MestQ07646 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MestQ07646 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MestQ07646 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MestQ07646 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MestQ07646 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MestQ07646 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MestQ07646 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MestQ07646 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MestQ07646 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MestQ07646 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MestQ07646 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MestQ07646 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MestQ07646 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MestQ07646 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MestQ07646 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MestQ07646 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MestQ07646 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MestQ07646 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MestQ07646 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms