Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gdf3Q07104 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdf3Q07104 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms