Protein–RNA interactions for Protein: Q06806

Tie1, Tyrosine-protein kinase receptor Tie-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tie1Q06806 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tie1Q06806 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tie1Q06806 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tie1Q06806 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tie1Q06806 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tie1Q06806 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tie1Q06806 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tie1Q06806 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tie1Q06806 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tie1Q06806 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tie1Q06806 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tie1Q06806 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tie1Q06806 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tie1Q06806 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tie1Q06806 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tie1Q06806 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tie1Q06806 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tie1Q06806 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tie1Q06806 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tie1Q06806 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tie1Q06806 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tie1Q06806 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tie1Q06806 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms