Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrstQ06666 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrstQ06666 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrstQ06666 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SrstQ06666 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrstQ06666 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrstQ06666 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrstQ06666 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrstQ06666 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SrstQ06666 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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