Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cdk18Q04899 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cdk18Q04899 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms