Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Sox12Q04890 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sox12Q04890 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms