Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Emx2Q04744 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Emx2Q04744 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms