Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cxcr5Q04683 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cxcr5Q04683 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms