Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnd1Q03719 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnd1Q03719 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnd1Q03719 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kcnd1Q03719 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnd1Q03719 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms