Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl7Q03366 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl7Q03366 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms