Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NfiaQ02780 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NfiaQ02780 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NfiaQ02780 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NfiaQ02780 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms