Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ctnnb1Q02248 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ctnnb1Q02248 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms