Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ascl1Q02067 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ascl1Q02067 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms