Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nme2Q01768 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms