Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gjb2Q00977 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gjb2Q00977 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb2Q00977 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms