Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rbp1Q00915 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rbp1Q00915 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms