Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VegfaQ00731 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VegfaQ00731 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VegfaQ00731 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms