Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SeleQ00690 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SeleQ00690 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SeleQ00690 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SeleQ00690 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SeleQ00690 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SeleQ00690 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeleQ00690 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeleQ00690 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SeleQ00690 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SeleQ00690 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SeleQ00690 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SeleQ00690 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SeleQ00690 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SeleQ00690 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SeleQ00690 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms