Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GabpaQ00422 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms