Protein–RNA interactions for Protein: P97858

Slc35b1, Solute carrier family 35 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35b1P97858 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc35b1P97858 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc35b1P97858 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms