Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smarcc1P97496 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smarcc1P97496 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smarcc1P97496 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms