Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubg1P83887 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tubg1P83887 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms