Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TgfbiP82198 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TgfbiP82198 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TgfbiP82198 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TgfbiP82198 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TgfbiP82198 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TgfbiP82198 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TgfbiP82198 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TgfbiP82198 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TgfbiP82198 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TgfbiP82198 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TgfbiP82198 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TgfbiP82198 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TgfbiP82198 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TgfbiP82198 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TgfbiP82198 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TgfbiP82198 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TgfbiP82198 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TgfbiP82198 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TgfbiP82198 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TgfbiP82198 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TgfbiP82198 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TgfbiP82198 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TgfbiP82198 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TgfbiP82198 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TgfbiP82198 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TgfbiP82198 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TgfbiP82198 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms