Protein–RNA interactions for Protein: P81269

Atf1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf1P81269 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf1P81269 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atf1P81269 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf1P81269 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf1P81269 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf1P81269 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf1P81269 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf1P81269 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf1P81269 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atf1P81269 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms