Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gabpb2P81069 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gabpb2P81069 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms