Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Irx2P81066 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx2P81066 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx2P81066 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx2P81066 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx2P81066 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx2P81066 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx2P81066 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx2P81066 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx2P81066 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx2P81066 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms