Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otx2P80206 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otx2P80206 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Otx2P80206 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Otx2P80206 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Otx2P80206 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otx2P80206 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx2P80206 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx2P80206 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Otx2P80206 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms