Protein–RNA interactions for Protein: P70677

Casp3, Caspase-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp3P70677 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp3P70677 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp3P70677 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp3P70677 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp3P70677 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Casp3P70677 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp3P70677 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp3P70677 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp3P70677 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Casp3P70677 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp3P70677 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp3P70677 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp3P70677 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp3P70677 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Casp3P70677 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms